Seit 1985 befindet sich der Firmensitz der HLB in Frankfurt. Neben der Geschäftsführung stellt die HLB auch den Eisenbahnbetriebsleiter. Die Holding erbringt Dienstleistungen für die Standorte in den folgenden Bereichen: Personal, Technik, Rechnungswesen, EDV, Controlling, Verkehrs- und Angebotsplanung, Marketing, Bündelung von Aktivitäten, strategische Ausrichtung und Qualitätsmanagement.
Der Firmensitz befindet sich in unmittelbarer Nähe des Frankfurter Hauptbahnhofs und ist somit sehr gut mit öffentlichen Verkehrsmitteln zu erreichen.